WEBVTT FILE 1 00:10.350 --> 00:15.000 Le microbiote c’est le monde bactérien avec lequel 2 00:15.200 --> 00:17.560 nous coexistons et nous co-évoluons. 3 00:18.420 --> 00:22.120 Cette notion est nouvelle, elle est connue depuis 4 00:22.320 --> 00:25.860 longtemps mais elle est vraiment venue au premier rang de 5 00:26.060 --> 00:28.520 l’actualité médicale depuis quelques années. 6 00:29.106 --> 00:31.410 Le microbiote, ce sont tous les germes avec lesquels 7 00:31.453 --> 00:36.140 nous coexistons ou disons tout le monde microbien avec lequel nous coexistons. 8 00:36.213 --> 00:40.500 Alors on va essayer de successivement parler de ce 9 00:40.700 --> 00:43.400 microbiote même, de son origine, son développement, 10 00:43.600 --> 00:48.000 sa composition, le lien entre la biodiversité 11 00:48.610 --> 00:53.360 et le risque allergique qui est un élément très important 12 00:53.790 --> 00:56.940 dans le monde et enfin le microbiote des malades, c'est 13 00:57.026 --> 00:58.293 ce qu'on appelle les dysbioses. 14 00:59.150 --> 01:03.660 Alors, normalement le microbiote, comme vous le voyez sur 15 01:03.860 --> 01:09.120 ce schéma, ce petit ADN d’acide désoxyribonucléique 16 01:09.200 --> 01:12.060 qui tourne sur lui-même, c'est l'ADN que nous avons dans 17 01:12.260 --> 01:17.560 notre corps, nous avons environ, 18 01:18.140 --> 01:21.160 pas très loin de 2 milliards de paires de base d’acide 19 01:21.360 --> 01:24.740 désoxyribonucléique qui sont à nous, c'est notre corps, c'est 20 01:25.190 --> 01:28.026 notre peau, nos yeux, nos intestins, notre cœur etc. 21 01:30.250 --> 01:34.020 En haut à droite et en bas, vous avez 22 01:35.190 --> 01:37.840 l'ADN qui correspond aux différentes cellules 23 01:38.040 --> 01:41.950 microbiennes qui sont, on ne peut pas dire infectées car 24 01:42.150 --> 01:45.110 elles coexistent avec nous, qui sont sur la peau, qui 25 01:45.310 --> 01:48.710 sont dans la cavité buccale et qui sont dans l'intestin 26 01:48.910 --> 01:52.380 et il y en a aussi dans le vagin chez les dames, il y en 27 01:52.580 --> 01:55.453 a aussi dans la bouche, il y en a aussi dans différents autres endroits. 28 01:55.920 --> 01:59.120 Et l'homme, comme tous les êtres vivant d'ailleurs 29 01:59.780 --> 02:04.470 co-évolue, on appelle ça le microbiome ou le méta génome 30 02:04.720 --> 02:07.670 et ce sont des compléments métaboliques indispensables et 31 02:07.870 --> 02:09.660 longtemps méconnus de notre génome. 32 02:09.860 --> 02:12.690 C'est ça qui fait que par exemple, l’homme qui n’est pas 33 02:12.890 --> 02:15.573 équipé pour ça, digère assez facilement une pomme alors 34 02:15.600 --> 02:17.260 que normalement il n'a pas ce qu'il faut. 35 02:17.370 --> 02:21.890 Alors, le microbiote, la large structure, l'arbre 36 02:22.090 --> 02:26.550 du microbiote n'est pas un arbre phylogénétique analogue 37 02:27.490 --> 02:30.790 à un arbre normal mais est plutôt analogue à un palmier, 38 02:31.090 --> 02:35.570 ce qui veut dire qu'en fait l'arborescence de la vie 39 02:35.810 --> 02:38.040 est assez particulière et 40 02:40.270 --> 02:44.840 le changement chez l'homme, de l'écologie, va affecter cette 41 02:45.040 --> 02:49.660 composition de façon très forte et ici sont listés 42 02:49.860 --> 02:53.210 un certain nombre d'éléments qui sont à l'origine de ces changements: 43 02:53.540 --> 02:54.840 la qualité de l'eau, 44 02:55.973 --> 03:05.240 deuxièmement, la fréquence des césariennes, 45 03:05.610 --> 03:10.840 l'incidence des antibiotiques, en particulier chez enfant, 46 03:12.070 --> 03:14.770 la réduction de l'allaitement maternel, 47 03:15.210 --> 03:18.300 le fait que les familles sont généralement de plus petite taille, 48 03:18.830 --> 03:21.620 les antibiotiques sont diffusés de façon excessive, 49 03:25.013 --> 03:27.653 on se lave mieux, on se douche plus souvent, 50 03:28.030 --> 03:31.150 enfin, on utilise très souvent aussi par exemple 51 03:31.350 --> 03:34.860 des amalgames au mercure dans les amalgames dentaires, 52 03:35.060 --> 03:38.350 Tous ces éléments vont changer fortement la composition 53 03:39.000 --> 03:41.230 du microbiote des intestins, de la bouche etc. 54 03:42.100 --> 03:45.000 Donc on en a listé qu'une partie, il y a un nombre 55 03:45.200 --> 03:49.450 incroyable d’activités humaines qui vont être responsables de ce changement. 56 03:49.650 --> 03:52.780 Vous voyez ici ce qu'on appelle l'arbre phylogénétique c'est-à-dire 57 03:53.260 --> 03:55.480 des espèces de bactéries où vous voyez que les deux 58 03:55.680 --> 03:59.340 espèces dominantes ce sont surtout les bactérioides et 59 03:59.540 --> 04:03.070 les firmicutes et que cette différence, cette répartition 60 04:03.270 --> 04:07.180 très particulière se retrouve chez le chien, chez 61 04:07.380 --> 04:11.310 le porc, comme chez l'homme de façon très comparable. 62 04:12.000 --> 04:16.330 La composition en bactéries de l'intestin des animaux, 63 04:16.530 --> 04:19.780 des grands animaux que nous sommes, qu’est le chien, 64 04:22.370 --> 04:26.350 dépend évidemment très initialement 65 04:27.320 --> 04:31.310 des bactéries du sol mais elle est très particulière. 66 04:31.510 --> 04:34.640 Il y a manifestement une sélection de bactéries par l'homme 67 04:34.850 --> 04:39.720 car nous n'avons pas les 53 genres de 68 04:39.810 --> 04:42.340 bactéries qui existent dans le sol, nous n'en avons que 69 04:42.540 --> 04:45.700 deux ou trois, des dominants, et ceci correspond à une 70 04:45.900 --> 04:50.000 sélection darwinienne car nous ne sélectionnons que 71 04:50.053 --> 04:51.430 les bactéries qui nous sont utiles. 72 04:51.900 --> 04:54.460 Le microbiote varie beaucoup dans les différentes parties 73 04:55.140 --> 04:58.520 du corps humain et l'élément majeur de la variation c'est 74 04:58.840 --> 05:02.200 effectivement la proximité de l'endroit du corps humain 75 05:02.400 --> 05:04.230 avec l'environnement extérieur. 76 05:04.430 --> 05:07.940 Vous voyez qu'à l'évidence, dans le vagin ou dans 77 05:08.140 --> 05:11.780 la bouche, la composition est très différente qu'elle ne l'est 78 05:12.110 --> 05:14.890 au milieu des intestins par exemple et c'est ce que 79 05:15.360 --> 05:18.560 souligne un des éléments importants, c’est les relations 80 05:18.560 --> 05:21.253 entre le microbiote et l'environnement extérieur. 81 05:21.440 --> 05:24.880 Alors il existe un certain nombre de liens statistiques 82 05:25.080 --> 05:28.560 et même physiopathologiques entre plusieurs maladies et 83 05:28.760 --> 05:31.300 la composition microbienne de l'intestin, c'est ce qu'on 84 05:31.500 --> 05:35.000 appelle les dysbioses. La composition du microbiome par 85 05:35.200 --> 05:38.000 exemple est un des éléments déterminants de l'obésité et 86 05:38.200 --> 05:40.730 du diabète de type II. 87 05:41.430 --> 05:45.000 On sait qu'à plusieurs niveaux, cette composition est 88 05:45.200 --> 05:48.350 très particulière, cause ou effet, ça on n'en sait rien pour l'instant. 89 05:50.950 --> 05:55.680 Un très beau travail fait par l'INRA par 90 05:55.930 --> 06:00.760 Madame le Chatellier, a montré par exemple que chez 91 06:00.960 --> 06:03.230 les obèses, comme vous le voyez sur cette courbe, 92 06:03.430 --> 06:06.190 la courbe en rouge, par rapport à la courbe en bleu, il y a 93 06:06.390 --> 06:11.150 une diminution de la composition 94 06:11.350 --> 06:13.400 du nombre de gènes bactériens du digestif. 95 06:14.720 --> 06:17.540 En gros, les obèses possèdent moins de gènes bactériens 96 06:17.740 --> 06:20.973 intestinaux que les non obèses. 97 06:23.080 --> 06:25.690 D'autres travaux actuellement sont en cours pour 98 06:26.420 --> 06:30.786 spécifier cette affection qui est très particulière. 99 06:31.560 --> 06:34.360 Alors, en ce qui concerne les maladies auto-immunes 100 06:34.560 --> 06:38.090 et allergiques qui, rappelons-le, son des maladies 101 06:38.290 --> 06:43.220 complexes, qui supposent un terrain génétique particulier 102 06:43.420 --> 06:45.390 et qui sont la réaction due 103 06:48.480 --> 06:51.320 à une déficience de la réaction immunitaire que l'on peut 104 06:52.120 --> 06:56.590 en gros schématiser ici car cette hypothèse dite 105 06:56.790 --> 07:01.060 hygiéniste a eu une jouvence nouvelle et a une version 106 07:01.260 --> 07:04.910 dite microbiotique, la version microbiotique étant que 107 07:05.110 --> 07:07.560 dans la paroi intestinale, vous avez la paroi intestinale 108 07:07.760 --> 07:11.670 dessinée ici sous forme d'un trait d'union, vous avez à l'intérieur 109 07:11.870 --> 07:14.900 les petits ronds, à l'extérieur des petits triangles, à l'intérieur 110 07:15.100 --> 07:19.310 ce sont les bactéries causales et à l'extérieur c'est 111 07:19.310 --> 07:20.270 le système immunitaire. 112 07:20.470 --> 07:23.890 Alors en principe les bactéries dans le tissu normal sont 113 07:24.090 --> 07:26.110 à l'origine d'un certain nombre de caractéristiques 114 07:26.310 --> 07:29.900 du système immunitaire et lorsqu'il y a une déficience 115 07:30.100 --> 07:32.580 des bactéries, ces éléments du système immunitaire - 116 07:32.653 --> 07:35.773 vous voyez ici les petits triangles verts et grenats -, 117 07:36.200 --> 07:39.150 deviennent en gros inoccupés, sans lien avec l'origine 118 07:39.380 --> 07:42.380 bactérienne et peuvent donc - c’est la troisième partie 119 07:42.580 --> 07:48.013 du schéma -, avoir une activité qui est figurée ici vers l'extérieur 120 07:52.853 --> 07:55.870 et ce sont donc des éléments immunitaires qui peuvent donc se retourner 121 07:56.070 --> 07:59.590 contre nous-mêmes et être à l'origine de la réaction auto-immune. 122 08:00.150 --> 08:03.690 C'est très grossièrement dessiner ce qu'on appelle l'hypothèse 123 08:03.890 --> 08:05.653 hygiéniste dans sa version microbiotique.